El Banco Central de Cuba cuenta con un equipo de auditores internos cuya misión consiste en:

• Realizar un trabajo asesor de la más alta Dirección, con el fin de lograr un valor agregado al resultado y coadyuvar al alcance de los objetivos de la institución.
• Combatir el delito y la desviación de los recursos del Estado mediante la observancia contínua del cumplimiento de los Principios de Control Interno inherentes a todos los subsistemas de control en ejecución.
• Realizar un trabajo profiláctico presentando, en cada auditoría, útiles recomendaciones que faciliten la erradicación de las causas de las deficiencias que se reporten.

El equipo de auditores internos del Banco Central de Cuba tiene entre sus objetivos de trabajo:

• la ejecución de auditorías in situ por temáticas, según el plan aprobado,
• la ejecución de la auditoría a distancia a través del sistema automatizado en red,
• el diseño y actualización de la Matriz de Riesgos de cada unidad organizativa,
• el estudio de todos los proyectos de procedimientos que se diseñen, antes de ser establecidos en el Manual de Instrucciones de la Institución, y
• la participación en la comisión permanente para la destrucción de billetes y monedas no aptos para la circulación.

Además de los mencionados objetivos, los auditores internos participan en otras tareas investigativas que le son orientadas por la máxima Dirección de la institución.